Jurnal Rekayasa Mesin terbit pertama kali pada tahun 1997 dalam format cetak. Pada tahun 2007 Jurnal Rekayasa Mesin versi cetak mendapatkan nomor ISSN (p-ISSN: 1411-6863). Jurnal Rekayasa Mesin kemudian mulai mengembangkan versi online untuk membuka akses bagi masyarakat luas. Jurnal Rekayasa Mesin yang bisa diakses secara online adalah volume 11 terbitan tahun 2013. Sistem daring penuh untuk pengelolaan Jurnal Rekayasa Mesin mulai diterapkan sejak tahun 2016. Dengan pengelolaan secara daring ini, maka pada tahun 2016 Jurnal Rekayasa Mesin mendapatkan nomor E-ISSN (e-ISSN: 2540-7678). Jurnal Rekayasa Mesin terindeks di google scholar dan portal Garuda. Selain upaya memperbaiki tata kekola, Jurnal Rekayasa Mesin juga berusama untuk meningkatkan kualitas publikasi, diantaranya dengan menyediakan template bagi para penulis. Upaya peningkatan kualitas juga dilakukan dengan pengajuan akreditasi jurnal. Pada tahun 2019, JUrnal Rekayasa Mesin mengajukan akreditasi Sinta.